蜂蜜不可以用开水冲或高温蒸煮。因为不合理的加热，会使蜂蜜中的营养物质被破坏，蜂蜜中的酶失活，颜色变深，香味挥发，滋味改变，吃起来有不愉快的酸味。因此，蜂蜜最好使用40℃以下的温开水或凉开水稀释后食用，特别是在炎热的夏季，用冷开水冲蜂蜜饮食，能消暑解热，是很好的清凉保健饮料。
蜂蜜的食用时间大有讲究，一般在饭前1至1.5小时或饭后2至3小时食用比较适宜。但对有胃肠道疾病的患者，则应根据病情确定食用时间，以利于发挥其医疗作用。如在饭前1.5小时食用蜂蜜，它可抑制胃酸的分泌；如在食用蜂蜜后立即进食，它又会刺激胃酸的分泌；温热的蜂蜜水能使胃液稀释而降低胃液酸变，而冷的蜂蜜水却可提高胃液酸度，并能刺激肠道的蠕动，有轻泻作用。因此，胃酸过多或肥大性胃炎，特别是胃十二指肠溃疡的患者，宜在饭前1.5小时食用温蜂蜜水，不仅能抑制胃酸的分泌，而且能使胃酸降低，从而减少对胃黏膜的刺激，有利于溃疡面的愈合；而胃酸缺乏或萎缩性胃炎的患者，宜食用冷蜜水后立即进食。神经衰弱者在每天睡觉前食用蜂蜜，可以促进睡眠，因为蜂蜜有安神益智和改善睡眠的作用。
蜂蜜的吃法有很多，可以和牛奶、面包、蔬菜汁、茶、鲜果汁、粥类、清汤、豆浆等任何类型的早餐搭配食用。但蜂蜜不宜与豆腐同食。豆腐性寒，能清热散血，与蜂蜜同食易导致腹泻，同时蜂蜜中的多种酶类与豆腐中的多种矿物质、植物蛋白、有机酸等同食不利于人体的生化反应；另外蜂蜜还不宜与韭菜同食。韭菜富含维生素C，容易被蜂蜜中的矿物质铜、铁等离子氧化而失去作用。另外，蜂蜜可通便，而韭菜富含纤维素易导泻，会引发腹泻。
